Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2B1Q9NRF2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH2B1Q9NRF2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SH2B1Q9NRF2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SH2B1Q9NRF2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms