Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF3Q9NR81 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARHGEF3Q9NR81 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF3Q9NR81 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARHGEF3Q9NR81 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms