Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX1

PRDM5, PR domain zinc finger protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM5Q9NQX1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM5Q9NQX1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM5Q9NQX1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM5Q9NQX1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms