Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
XPNPEP3Q9NQH7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms