Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7V2

SYNDIG1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1Q9H7V2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYNDIG1Q9H7V2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNDIG1Q9H7V2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNDIG1Q9H7V2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms