Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2I8

LRMDA, Leucine-rich melanocyte differentiation-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRMDAQ9H2I8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRMDAQ9H2I8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRMDAQ9H2I8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRMDAQ9H2I8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms