Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EHD4Q9H223 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EHD4Q9H223 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
EHD4Q9H223 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EHD4Q9H223 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms