Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D6

XRN2, 5'-3' exoribonuclease 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRN2Q9H0D6 RAD23A-210ENST00000593114 1691 ntTSL 518.45■□□□□ 0.548e-12■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.542e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 FLII-227ENST00000581858 644 ntTSL 518.39■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 DGKD-203ENST00000427930 482 ntTSL 518.38■□□□□ 0.535e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 MFSD12-205ENST00000585814 1002 ntTSL 318.21■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 CBFA2T3-205ENST00000563856 2380 ntTSL 218.2■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 RNH1-214ENST00000529115 855 ntTSL 318.2■□□□□ 0.55e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 MECP2-218ENST00000629277 2558 nt18.09■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 FLII-213ENST00000493600 656 ntTSL 218.06■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 CCDC92-203ENST00000539551 860 ntTSL 317.82■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 RNH1-218ENST00000531149 709 ntTSL 317.66■□□□□ 0.425e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 SFSWAP-207ENST00000538548 2636 ntTSL 517.63■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 KLHDC4-217ENST00000566661 2232 ntTSL 517.59■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.45e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 FLII-206ENST00000474265 596 ntTSL 217.41■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 PLEKHA6-204ENST00000564627 275 ntTSL 317.32■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 UNC13D-208ENST00000587105 776 ntTSL 317.22■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 UNC13D-205ENST00000586147 589 ntTSL 517.09■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 YWHAB-207ENST00000631616 5867 ntTSL 1 (best)17■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 CSK-211ENST00000568329 1552 ntTSL 516.95■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ELAC2-209ENST00000487229 2452 ntTSL 216.94■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 IRF2-203ENST00000504340 565 ntTSL 416.84■□□□□ 0.298e-8■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ELAC2-207ENST00000480891 2737 ntTSL 216.81■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 IRF2-207ENST00000509274 591 ntTSL 416.72■□□□□ 0.278e-8■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 WDR4-203ENST00000463902 609 ntTSL 316.63■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 MFSD12-213ENST00000592652 486 ntTSL 516.58■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 UNC13D-210ENST00000587504 1050 ntTSL 516.48■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 IRF2-208ENST00000510814 568 ntTSL 416.43■□□□□ 0.228e-8■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 GALNS-203ENST00000562593 5682 ntTSL 1 (best)16.24■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 AC012313.3-203ENST00000596636 436 ntTSL 516.18■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 PRKY-201ENST00000472666 288 ntTSL 316.02■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 RAD23A-205ENST00000588826 832 ntTSL 516.01■□□□□ 0.158e-12■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.151e-11■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ATAT1-210ENST00000479562 691 ntTSL 515.97■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 NOP53-210ENST00000599582 626 ntTSL 315.92■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ZC3H12A-204ENST00000640233 2721 ntTSL 515.85■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 RAD23A-206ENST00000590881 999 ntTSL 515.79■□□□□ 0.128e-12■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ELAC2-210ENST00000491478 758 ntTSL 515.72■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ELAC2-205ENST00000465825 2793 ntTSL 215.62■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 IRF2-205ENST00000506230 498 ntTSL 215.57■□□□□ 0.088e-8■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 RNH1-208ENST00000524780 1059 ntTSL 215.5■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 RIPOR1-217ENST00000566907 634 ntTSL 415.49■□□□□ 0.075e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.071e-11■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 SLC35E2B-202ENST00000481276 2199 ntTSL 215.37■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 CSK-203ENST00000562066 533 ntTSL 415.37■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 KATNB1-206ENST00000566611 3854 ntTSL 215.35■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 NOP53-203ENST00000594525 876 ntTSL 1 (best)15.22■□□□□ 0.032e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.028e-12■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 WDR4-205ENST00000476326 1977 ntTSL 1 (best)15.13■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.011e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 01e-7■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 SPSB3-212ENST00000569769 580 ntTSL 315.04■□□□□ -08e-12■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 NAA38-204ENST00000575208 529 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.033e-17■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 NUDC-204ENST00000484772 607 ntTSL 214.71□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 AKAP1-214ENST00000575032 570 ntTSL 314.65□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 KATNB1-205ENST00000563462 827 ntTSL 514.54□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 EIF4G1-231ENST00000464548 637 ntTSL 514.54□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 YWHAB-204ENST00000445830 556 ntTSL 214.46□□□□□ -0.092e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 PSD4-204ENST00000418251 5600 ntTSL 514.45□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ATAT1-204ENST00000330083 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 AC093627.3-201ENST00000467050 574 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 RNF213-214ENST00000572622 320 ntTSL 314.12□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 PSD4-210ENST00000485525 586 ntTSL 414.06□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 ATAT1-209ENST00000471782 1527 ntTSL 1 (best)13.89□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.192e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 FLII-218ENST00000577485 555 ntTSL 513.8□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 36
XRN2Q9H0D6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 36
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