Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ACTR3CQ9C0K3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ACTR3CQ9C0K3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ACTR3CQ9C0K3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms