Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRRCC1Q9C099 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
LRRCC1Q9C099 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LRRCC1Q9C099 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms