Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NMES1Q9C002 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NMES1Q9C002 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NMES1Q9C002 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms