Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTRT3Q9BYD9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTRT3Q9BYD9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACTRT3Q9BYD9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms