Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW19

KIFC1, Kinesin-like protein KIFC1, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC1Q9BW19 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIFC1Q9BW19 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIFC1Q9BW19 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KIFC1Q9BW19 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIFC1Q9BW19 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIFC1Q9BW19 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIFC1Q9BW19 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIFC1Q9BW19 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KIFC1Q9BW19 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KIFC1Q9BW19 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms