Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC3

DSCC1, Sister chromatid cohesion protein DCC1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSCC1Q9BVC3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DSCC1Q9BVC3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
DSCC1Q9BVC3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
DSCC1Q9BVC3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DSCC1Q9BVC3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms