Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PAGR1Q9BTK6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PAGR1Q9BTK6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PAGR1Q9BTK6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PAGR1Q9BTK6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms