Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TM2D3Q9BRN9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TM2D3Q9BRN9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TM2D3Q9BRN9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM2D3Q9BRN9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM2D3Q9BRN9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM2D3Q9BRN9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM2D3Q9BRN9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM2D3Q9BRN9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TM2D3Q9BRN9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM2D3Q9BRN9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM2D3Q9BRN9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM2D3Q9BRN9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TM2D3Q9BRN9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM2D3Q9BRN9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TM2D3Q9BRN9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TM2D3Q9BRN9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms