Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RTP3Q9BQQ7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RTP3Q9BQQ7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTP3Q9BQQ7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTP3Q9BQQ7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms