Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCF25Q9BQ70 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TCF25Q9BQ70 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TCF25Q9BQ70 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms