Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DDX50Q9BQ39 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDX50Q9BQ39 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDX50Q9BQ39 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms