Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CGREF1Q99674 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CGREF1Q99674 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CGREF1Q99674 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms