Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOTCH4Q99466 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NOTCH4Q99466 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NOTCH4Q99466 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms