Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAP1L3Q99457 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAP1L3Q99457 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NAP1L3Q99457 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NAP1L3Q99457 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms