Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TCF12Q99081 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TCF12Q99081 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TCF12Q99081 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms