Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
SIN3AQ96ST3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SIN3AQ96ST3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SIN3AQ96ST3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
SIN3AQ96ST3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SIN3AQ96ST3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms