Protein–RNA interactions for Protein: Q96SK2

TMEM209, Transmembrane protein 209, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM209Q96SK2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM209Q96SK2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM209Q96SK2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM209Q96SK2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms