Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCCC1Q96RQ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MCCC1Q96RQ3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MCCC1Q96RQ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms