Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY8

NECTIN4, Nectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN4Q96NY8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NECTIN4Q96NY8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NECTIN4Q96NY8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NECTIN4Q96NY8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms