Protein–RNA interactions for Protein: Q96N77

ZNF641, Zinc finger protein 641, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF641Q96N77 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF641Q96N77 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF641Q96N77 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF641Q96N77 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms