Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW7

TIGD1, Tigger transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD1Q96MW7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TIGD1Q96MW7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TIGD1Q96MW7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIGD1Q96MW7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIGD1Q96MW7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIGD1Q96MW7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TIGD1Q96MW7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIGD1Q96MW7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIGD1Q96MW7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIGD1Q96MW7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIGD1Q96MW7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TIGD1Q96MW7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIGD1Q96MW7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIGD1Q96MW7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TIGD1Q96MW7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TIGD1Q96MW7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TIGD1Q96MW7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TIGD1Q96MW7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TIGD1Q96MW7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TIGD1Q96MW7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms