Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZNF488Q96MN9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
ZNF488Q96MN9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZNF488Q96MN9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms