Protein–RNA interactions for Protein: Q96KP6

TNIP3, TNFAIP3-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP3Q96KP6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNIP3Q96KP6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TNIP3Q96KP6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNIP3Q96KP6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms