Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
COX4I2Q96KJ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COX4I2Q96KJ9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms