Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
USP47Q96K76 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
USP47Q96K76 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
USP47Q96K76 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
USP47Q96K76 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
USP47Q96K76 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms