Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM87BQ96K49 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM87BQ96K49 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM87BQ96K49 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM87BQ96K49 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TMEM87BQ96K49 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM87BQ96K49 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms