Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LTV1Q96GA3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
LTV1Q96GA3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
LTV1Q96GA3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
LTV1Q96GA3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms