Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MS4A6EQ96DS6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MS4A6EQ96DS6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MS4A6EQ96DS6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A6EQ96DS6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MS4A6EQ96DS6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A6EQ96DS6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A6EQ96DS6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A6EQ96DS6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A6EQ96DS6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A6EQ96DS6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MS4A6EQ96DS6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms