Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
OPTNQ96CV9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.53■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.52■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
OPTNQ96CV9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
OPTNQ96CV9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
OPTNQ96CV9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms