Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GRAMD1AQ96CP6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRAMD1AQ96CP6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRAMD1AQ96CP6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms