Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EAF2Q96CJ1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EAF2Q96CJ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
EAF2Q96CJ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EAF2Q96CJ1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EAF2Q96CJ1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms