Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TM4SF18Q96CE8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TM4SF18Q96CE8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TM4SF18Q96CE8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms