Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EXOSC8Q96B26 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EXOSC8Q96B26 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms