Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RFT1Q96AA3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RFT1Q96AA3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms