Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP1MTQ969P6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TOP1MTQ969P6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TOP1MTQ969P6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms