Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLP1Q92989 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLP1Q92989 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CLP1Q92989 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms