Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SEMA4DQ92854 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4DQ92854 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4DQ92854 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms