Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KIFAP3Q92845 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIFAP3Q92845 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KIFAP3Q92845 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms