Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF516Q92618 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF516Q92618 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF516Q92618 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms