Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GATAD2BQ8WXI9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GATAD2BQ8WXI9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms