Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GIPC3Q8TF64 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GIPC3Q8TF64 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GIPC3Q8TF64 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms