Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY8

IGDCC4, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC4Q8TDY8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
IGDCC4Q8TDY8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.58■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.53■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.52■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
IGDCC4Q8TDY8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
IGDCC4Q8TDY8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGDCC4Q8TDY8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGDCC4Q8TDY8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
IGDCC4Q8TDY8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms